زیست فناوری

نوشته: کسری اصفهانی

برگزاری مجدد کارگاه جامع از ژن تا پروتئین - 5 تا 8 بهمن امسال
نویسنده : دکتر کسری اصفهانی - ساعت ۱٢:٥۳ ‎ب.ظ روز ۱۳٩۳/٩/٥
 

با توجه به استقبال از پنجمین و ششمین دوره آموزشی تکنیک های آزمایشگاه ژنتیک مولکولی که قرار است ماه آینده برگزار شود، این کارگاه را دوباره در اسفند ماه برگزار می کنم.

صفحه اولیه این کارگاه در این نشانی در دسترس است: http://biotechnews.ir/html/index.php?name=News&file=article&sid=860

فرم ثبت نام


 
comment نظرات ()
 
پنجمین دوره آموزشی تکنیک های آزمایشگاه ژنتیک مولکولی
نویسنده : دکتر کسری اصفهانی - ساعت ۱۱:۱٩ ‎ق.ظ روز ۱۳٩۳/٩/۱
 

هفته آینده (9تا 12 آذر) پنجمین دوره آموزشی تکنیک های آزمایشگاه ژنتیک مولکولی را با عنوان "از ژن تا پروتئین" در مرکز آموزش های تخصصی کوتاه مدت پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری برگزار می کنم. اگر کسی از دوستان علاقه داشتند در این کارگاه شرکت کنند، می توانند از لینکهای زیر اطلاعات لازم درباره نحوه ثبت نام را دریافت کنند.

فرم ثبت نام
صفحه کارگاه در سایت پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری
بازتاب خبری کارگاه در خبرگزاری ایسنا

 

 


 
comment نظرات ()
 
چهارمین دوره آموزشی تکنیک های آزمایشگاه ژنتیک مولکولی
نویسنده : دکتر کسری اصفهانی - ساعت ۱:۱٦ ‎ب.ظ روز ۱۳٩۳/٥/٤
 

خوشبختانه دوباره فرصتی شده تا چهارمین دوره آموزشی تکنیک های آزمایشگاه ژنتیک مولکولی را در قالب مدرسه تابستانی آموزشی، 1 تا 3 شهریور ماه امسال (همزمان با سیزدهمین کنگره علوم زراعت و اصلاح نباتات ایران) در مرکز آموزش های تخصصی کوتاه مدت پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری به عنوان مجری برگزار کنم.

در این دوره کوتاه مدت آموزشی که برای دانشجویان علاقمند به انجام پروژه های ژنتیک مولکولی و بیوتکنولوژی و با هزینه های پایین تری نسبت به دوره های مشابه برنامه ریزی شده است، تکنیک های معمول آزمایشگاهی مانند PCR، استخراج DNA، هضم آنزیمی، انتقال ژن، الکتروفورز و ... به صورت عملی و نظری آموزش داده می شود و در انتهای دوره آموزشی، به شرکت کنندگانی که با موفقیت دوره را به پایان برسانند، گواهینامه معتبر پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری اعطا می شود.

این دوره مناسب دانشجویانی است که می خواهند پایان نامه خود را به تازگی شروع کنند و آشنایی چندانی با تکنیک های آزمایشگاه ژنتیک مولکولی ندارند.

برنامه کارگاه

1 شهریور: آموزش PCR
- آشنایی با اصول PCR، واکنش و برنامه PCR
- انجام PCR
- انواع مختلف و کاربردهای PCR
- مبانی الکتروفورز و جداسازی قطعات DNA
- مشاهده محصولات PCR بر روی ژل آگاروز و آنالیز نتایج
- استخراج DNA

2 و 3 شهریور: مهندسی ژنتیک و کلونینگ DNA
- اصول مهندسی ژنتیک و آشنایی با مراحل یک پروژه کلونینگ DNA
- کاربردهای مهندسی ژنتیک
- آنزیم‌های برشی و هضم آنزیمی
- Ligation و کلونینگ DNA هدف
- انتقال DNA نوترکیب به باکتری پذیرنده E. Coli
- روش‌های مختلف آنالیز مولکولی صحت کلونینگ
- تایید کلونینگ با تکنیک Colony PCR
- الکتروفورز و مشاهده نتایج بررسی کلونی‌های نوترکیب
- بررسی و رفع مشکلات احتمالی PCR
- آشنایی با اصول طراحی پرایمر

* ساعت برگزاری کارگاه هر روز از 8:30 صبح تا 3:30 بعد از ظهر می باشد.

ظرفیت پذیرش دوره:
20 نفر

مهلت ثبت نام:
15 مرداد 1393


دوستان جهت پیش ثبت نام می توانند نام و نام خانوادگی، وضعیت تحصیلی و شماره تماس خود را تا 15 مرداد ماه به نشانی پست الکترونیکی iranbioelearning@gmail.com ارسال نمایند تا فرم ثبت نام و اطلاعات تکمیلی برای آنها ارسال شود.


هزینه ها

عادی

• دوره آموزشی سه روزه کامل تکنیک های آزمایشگاه ژنتیک مولکولی: 350 هزار تومان

- روز اول کارگاه (آموزش پی سی آر و استخراج دی ان ای): 140 هزار تومان

- روز دوم و سوم کارگاه (مهندسی ژنتیک و کلونینگ دی ان ای): 220 هزار تومان

دانشجویی

• دوره آموزشی سه روزه کامل تکنیک های آزمایشگاه ژنتیک مولکولی: 295 هزار تومان

- روز اول کارگاه (آموزش پی سی آر و استخراج دی ان ای): 120 هزار تومان

- روز دوم و سوم کارگاه (مهندسی ژنتیک و کلونینگ دی ان ای): 195 هزار تومان

هزینه های کارگاه شامل آموزش، مواد کمک آموزشی، مواد مصرفی آزمایشگاهی، ناهار و پذیرایی می باشد.

امکان اقامت برای شرکت کنندگان شهرستانی با قیمت ارزان در مهمانسرای پژوهشگاه فراهم است. این مهمانسرا در محوطه پژوهشگاه واقع شده است.

همچنین برای این دوره نیز 2 متقاضی از مناطق محروم (مطابق مصوبه مجلس شورای اسلامی برای تعیین مناطق محروم و کمتر توسعه یافته در امور حمایتی قابل دستیابی در نشانی: http://rc.majlis.ir/fa/law/show/135738) با معدل بالای 17 با هزینه 150هزار تومان برای کل دوره ثبت نام می شوند. متقاضیان برای این منظور می بایست هنگام ثبت نام، اسکن آخرین مدرک تحصیلی یا کارنامه ترم قبل خود را با مدرکی حاکی از اقامت یا تحصیل در این مناطق (اسکن کارت دانشجویی یا شناسنامه) همراه با فایل سایر مدارک به نشانی پست الکترونیکی کارگاه (iranbioelearning@gmail.com ) ارسال نمایند.

جهت کسب اطلاعات بیشتر در مورد کارگاه ها و دوره های تخصصی کوتاه مدت پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری می توانید با شماره 09183886384 آقای مهندس معتمدی تماس حاصل نمایید.

مکان برگزاری کارگاه: تهران، کیلومتر 17 اتوبان تهران کرج، بلوار پژوهش، پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری

لینک صفحه اینترنتی کارگاه
پوستر کارگاه


 
comment نظرات ()
 
تکرار دوره آموزشی فشرده دو روزه تکنیک های آزمایشگاه ژنتیک مولکولی‎
نویسنده : دکتر کسری اصفهانی - ساعت ٩:٢٠ ‎ق.ظ روز ۱۳٩٢/٩/۱٦
 
با سلام خدمت همکاران عزیز

در ابتدا از همکاران عزیزی که از شهرهای مختلف کشورمان مثل تهران، کرج، شیراز، اصفهان و ارومیه در دوره آموزشی فشرده دو روزه تکنیک های آزمایشگاه ژنتیک مولکولی که ششم و هفتم آذر ماه برگزار شد، شرکت نمودند سپاسگزاری می نمایم.


با توجه به استقبال قابل توجه و ابراز علاقمندی تعداد زیادی از دوستان خصوصاً دانشجویان گرامی برای شرکت در این دوره که با حداقل هزینه ثبت نام طراحی شده است، این دوره دوباره برگزار خواهد شد.

 بنابراین خواهشمند است دوستانی که تمایل به شرکت در این دوره آموزشی داشتند و به دلیل زمان برگزاری آن نتوانسته اند در آن شرکت کنند، تاریخ پیشنهادی مورد نظر خود را در فرم زیر مشخص کرده و به پست الکترونیکی
iranbioelearning@gmail.com ارسال نمایند.

روزهای هفته که می توانید در کارگاه شرکت نمایید:
  • شنبه - یک شنبه
    دوشنبه - سه شنبه
  • چهارشنبه - پنجشنبه

تاریخ ها:
  • هفته سوم آذر (16-21)
  • هفته آخر آذر (23-28)
  • دی ماه (تاریخ را ذکر نمایید)

لازم به ذکر است این دوره در بهمن امسال نیز مجدداً برگزار خواهد شد.


 
comment نظرات ()
 
دوره آموزشی فشرده دو روزه تکنیک های آزمایشگاه ژنتیک مولکولی
نویسنده : دکتر کسری اصفهانی - ساعت ۱٠:٥٦ ‎ق.ظ روز ۱۳٩٢/٩/٢
 

دوره آموزشی فشرده دو روزه تکنیک های آزمایشگاه ژنتیک مولکولی، 6 تا 7 آذر ماه امسال توسط شرکت شرکت دانا ژن ‌پژوه و با حمایت شبکه پزشکی مولکولی کشور به صورت نظری و عملی در محل دانشگاه الزهرا برگزار خواهد ‌شد.

در این دوره کوتاه مدت آموزشی که برای دانشجویان علاقمند به انجام پروژه های ژنتیک مولکولی و بیوتکنولوژی برنامه ریزی شده است، تکنیک های معمول آزمایشگاهی مانند PCR، استخراج DNA، هضم آنزیمی، انتقال ژن، الکتروفورز و ... به صورت عملی و نظری آموزش داده می شود و در انتهای دوره آموزشی، به شرکت کنندگانی که با موفقیت دوره را به پایان برسانند، گواهینامه معتبر انگلیسی شبکه پزشکی مولکولی اعطا می شود.

البته در این دوره، این امکان برای شرکت کنندگان وجود دارد که با توجه به علاقه خود در کل دوره یا بخش هایی از دوره آموزشی شرکت نمایند اما در صورت شرکت در کل دوره آموزشی، هزینه ها کاهش می یابد.

مزیت این دوره:
این دوره در مقایسه با دوره های مشابه، در مدت زمان کوتاهی (20 ساعت)، تمام تکنیک های معمول مورد نیاز برای دانشجویانی که بزودی کار بر روی پایان نامه خود را در آزمایشگاه های مولکولی آغاز می کنند، آموزش داده می شود. در کنار کاهش زمان آموزش، هزینه های این کارگاه (250 هزار تومان برای کل کارگاه) در مقایسه با کارگاه های مشابه بسیار پایین بوده و از این رو این دوره برای دانشجویان، خصوصاً دانشجویان شهرستانی که برای اقامت در تهران مشکل دارند، بسیار ایده آل است.

برنامه کارگاه

چهارشنبه 6 آذر- صبح (8:30-13:30): آموزش PCR
- آشنایی با اصول PCR، واکنش و برنامه PCR
- انجام PCR
- انواع مختلف و کاربردهای PCR
- مبانی الکتروفورز و جداسازی قطعات DNA
- مشاهده محصولات PCR بر روی ژل آگاروز و آنالیز نتایج

چهارشنبه 6 آذر- بعد از ظهر (14-19): مهندسی ژنتیک و کلونینگ DNA
- اصول مهندسی ژنتیک و آشنایی با مراحل یک پروژه کلونینگ DNA
- کاربردهای مهندسی ژنتیک
- آنزیم‌های برشی و هضم آنزیمی
- Ligation و کلونینگ DNA هدف
- انتقال DNA نوترکیب به باکتری پذیرنده E. Coli

پنج­شنبه 7 آذر- صبح (8:30-13:30): آنالیز مولکولی صحت کلونینگ و استخراج پلاسمید
- روش‌های مختلف آنالیز مولکولی صحت کلونینگ
- تایید کلونینگ با تکنیک Colony PCR
- الکتروفورز و مشاهده نتایج بررسی کلونی‌های نوترکیب
- استخراج پلاسمید به روش Mini-prep با استفاده از کیت

پنج­شنبه 7 آذر- بعد از ظهر (14-19): رفع اشکلات PCR و طراحی پرایمر

- بررسی و رفع مشکلات احتمالی PCR
- آشنایی با اصول طراحی پرایمر
- آشنایی با نرم افزار Oligo (نرم افزار تخصصی طراحی پرایمر)

ظرفیت پذیرش هر دوره:
12 نفر

مهلت ثبت نام:
ساعت 10 صبح 5 آذر 1392



علاقمندان جهت ثبت نام می توانند به سایت danagene.com مراجعه نمایند و از امکانات ثبت نام و پرداخت آنلاین که برای رفاه شرکت کنندگان در نظر گرفته شده است، استفاده نمایند. الویت ثبت نام با افرادی است که زودتر پیش ثبت نام نمایند و همچنین افرادی که در دوره کامل شرکت نمایند در الویت ثبت نام هستند. با توجه به ظرفیت بسیار محدود این دوره، خواهشمند است هر چه سریعتر نسبت به ثبت نام قطعی اقدام شود و در صورت تکمیل ظرفیت، علاقمندان برای ثبت نام در دوره های بعدی این کارگاه راهنمایی خواهند شد. البته هزینه های دوره های بعدی ممکن است افزایش یابد.


هزینه ها

عادی

دوره آموزشی کامل تکنیک های آزمایشگاه ژنتیک مولکولی: 280 هزار تومان

- آموزش PCR و طراحی پرایمر: 120 هزار تومان

آموزش PCR: 80 هزار تومان

طراحی پرایمر: 60 هزار تومان (همراه داشتن لپ تاپ توصیه می شود)

- مهندسی ژنتیک، کلونینگ DNA و استخراج پلاسمید: 180 هزار تومان

دانشجویی (با تخفیف)

دوره آموزشی کامل تکنیک های آزمایشگاه ژنتیک مولکولی: 250 هزار تومان

- آموزش PCR و طراحی پرایمر: 100 هزار تومان

آموزش PCR: 70 هزار تومان

طراحی پرایمر: 50 هزار تومان (همراه داشتن لپ تاپ توصیه می شود)

- مهندسی ژنتیک، کلونینگ DNA و استخراج پلاسمید: 150 هزار تومان


محل برگزاری کارگاه: تهران، بلوار کشاورز، نبش خیابان 16آذر، پلاک 78، ساختمان کمال الدین بهزاد، مرکز رشد دانشگاه الزهرا (س)، طبقه هشتم، واحد 811

با توجه به اینکه برای آموزش موثر، حداکثر تعداد شرکت کننده این کارگاه 12 نفر می‌باشد، الویت شرکت در کارگاه با کسانی است که زودتر ثبت نام نمایند و افرادی که با تاخیر ثبت نام نمایند، در الویت برگزاری کارگاه های بعدی قرار خواهند گرفت.

علاقمندان می‌توانند جهت اطلاعات بیشتر با شماره های 88978268 یا 09124708799 تماس حاصل فرمایند.

صفحه اینترنتی کارگاه ها

پیش ثبت نام در کارگاه ها

لینک خبر در سایت شبکه پزشکی مولکولی


سابقه برگزاری دوره
شرکت دانا ژن پژوه تا کنون ده ها کارگاه با حمایت شبکه پزشکی مولکولی، انجمن نانو فناوری و انجمن بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایران در حوزه بیوتکنولوژی برگزار نموده است. مدرس این کارگاه عضو هیات علمی پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری مجری 3 دوره آموزشی تکنیک های آزمایشگاه ژنتیک مولکولی و مدرسه تابستانی در این پژوهشگاه بوده است.

سر فصل های این دوره دقیقاً منطبق بر دوره های برگزار شده قبلی در پژوهشگاه بوده ولی برای رفاه حال دانشجویان مدت زمان و هزینه برگزاری دوره به نحو چشمگیری کاهش یافته است.

توضیحاتی درباره مباحث کارگاه
واکنش زنجیره ای پلیمراز یا به اختصار PCR به طور روزمره در اکثر آزمایشگاه های تشخیصی و تحقیقاتی استفاده می شود و در موارد بسیاری مثل شناسایی و جداسازی ژن ها، کلونینگ، طبقه‌بندی و شناسایی موجودات زنده، تشخیص بیماری‌های ژنتیکی و حتی پرونده‌های جنایی و تعیین هویت کاربرد دارد. در حال حاضر و نزدیک به 30 سال پس از معرفی این تکنیک، تحقیقات ژنتیک مولکولی بدون استفاده از آن قابل تصور نیست.

مهندسی‌ژنتیک و تکنیک‌های مورد استفاده در آن، علم زیست‌شناسی را دگرگون کرده است. با ظهور مهندسی‌ژنتیک و فناوری DNA نوترکیب، انسان به فناوری دست‌ورزی ژنتیکی موجودات زنده دست یافت و هم‌اکنون می‌تواند برای رفع نیازهای خود، به طور موثرتری موجودات زنده را به کار گیرد. مهندسی ژنتیک در کشاورزی، پزشکی و صنایع دارویی، صنایع تخمیری، صنایع نظامی، انرژی و محیط‌زیست کاربردهای گسترده‌ای دارد.

از این جهت مطالب این دوره برای فارغ‌التحصیلان و دانشجویان رشته‌های بیوتکنولوژی، ژنتیک‌‌مولکولی، گرایش‌های مختلف زیست‌شناسی، محیط‌ زیست، پزشکی، گیاهپزشکی، زراعت، باغبانی، صنایع‌غذایی و تمامی افرادی که به مباحث بیوتکنولوژی و مهندسی ژنتیک علاقمند می‌باشند، مناسب است.


 
comment نظرات ()
 
آزمایش های اولیه ابراز تراژن ها در گیاهان با استفاده از عناصری مانند پیشبرها
نویسنده : دکتر کسری اصفهانی - ساعت ٢:٠٥ ‎ب.ظ روز ۱۳٩٢/٧/٢٧
 

آزمایش­های اولیه ابراز تراژن­ها در گیاهان با استفاده از عناصری مانند پیشبرهای 35S، 19S و opine synthase که باعث ابراز نسبتاً دائمی تراژن­ها می­شوند، صورت گرفته است. چون آزمایش­های مهندسی ژنتیک گیاهی با تصحیحاتی روبرو شده­اند، دانشمندان بر آن شدند تا از پیشبرهای تنظیم­شونده که باعث ابراز ترا­ژن در شرایط خاص محیطی، بافت­های خاص یا مراحل خاص نمو می­شوند، استفاده کنند. سیستم­هایی نیز تهیه شده­اند که به دانشمندان اجازه می­دهد تا ابراز تراژن را به دلخواه القا کنند، ابراز بالای یک محصول خاص را داشته باشند یا یک محصول را بیان کنند که شاید در یک مرحله خاص از نمو برای گیاه سمی باشد. این سیستم­های القاشونده با تتراسایکلین، الکل، مس، شوک گرمایی و هورمون­های استروئیدی تنظیم می­شوند. بسیاری از این سیستم­ها دارای مشکل بوده و باعث ابراز تراژن در شرایط غیر القایی می­شوند.

برخی اوقات محققان نمی­خواهند که تراژن یا محصول آن در چند ساعت یا چند روز اول پس از انتقال ژن حضور داشته باشند. برخی صفات مثل آنهایی که در طی انتقال ژن به این فرآیند کمک می­کنند یا بر بازآرایی DNA گیاهی اثر دارند، فقط در اوایل واقعه انتقال ژن مورد نیاز هستند (سیستم­های site-specific recombinaseمورد استفاده در هدف­یابی ژن). دو راهبرد هستند که فقط اجازه ابراز موقت محصولات را در گیاهان می­دهند. این دو سیستم­های "غیر ادغام شونده"[1] T-DNA و انتقال پروتئین­ها به جای مولکول­های DNA از آگروباکتریوم به سلول­های گیاهی می­باشند.

سیستم­های غیر ادغامی T-DNA شامل استفاده از سویه­های جهش­یافته آگروباکتریوم یا سلول­های گیاهی می­باشد که کارآیی بالایی در انتقال هسته­ای T-DNA داشته ولی در ادغام T-DNA ناکارا هستند. در طی جستجو برای یافتن دامنه­هایی از VirD2 که برای هدف­یابی هسته­ای T-DNA لازم هستند، Shurvinton وهمکارانش یک دامنه پایانه-C[2] را که مشابهت بالایی در توالی­های اسید آمینه­ها در بین ژن­های virD2 نشان می­داد، مشخص کرده و آن را ω نامگذاری کردند. گرچه این دامنه نه در فعالیت اندونوکلئازی VirD2 و نه در هدف­یابی هسته­ای T-DNA لازم می­باشد، جایگزینی 4 اسید آمینه حفاظت­شده[3] آن با دو گروه سرین منجر به یک پروتئین جهش­یافته شد و رمز شدن آن در سویه آگروباکتریوم، باعث کاهش بسیار زیاد بیماری­زایی گردید. در ادامه Narasimhulu و همکارانش و Mysore و همکارانش نشان دادند که سویه­های آگروباکتریومی که این VirD2ω  جایگزین را حمل می­کنند، در انتقال ژن پایدار ناکارآمد بوده (2 درصد کارآیی سویه­های طبیعی) ولی هنوز توانایی انتقال ژن موقت به سلول­های گیاهی را تا 20 درصد کارآیی سویه­های طبیعی، حفظ کرده بودند. بنابراین، این جهش باعث کاهش قابل توجه کارآیی ادغام T-DNA در سویه­های آگروباکتریوم شده ولی نسبتاً کارآیی ارسال T-DNA به هسته گیاهی حفظ می­شود. این پروتئین جهش­یافته VirD2 می­تواند برای هدف­گیری رشته T به هسته استفاده شده و در آنجا بدون اینکه ادغام با کارآیی بالایی صورت گیرد، به طور موقت ابراز شود.

Nam و همکارانش 40 اکوتیپ A. thaliana را از لحاظ توانایی انتقال ژن به ریشه توسط آگروباکتریوم غربال کردند. در این میان، اکوتیپ UE-1 به راحتی انتقال ژن موقت در آن صورت می­گرفت ولی انتقال ژن پایدار در آن پایین بود. تعیین خصوصیات ژنتیکی و مولکولی این اکوتیپ نشان داد که انسداد در انتقال ژن در مرحله ادغام T-DNA صورت می­گیرد. تحقیقات بعدی Nam و همکارانش باعث شناسایی تعداد زیادی جهش­یافته با ورود T-DNA (rat) شدند که در مقابل انتقال ژن به واسطه آگروباکتریوم مقاوم بودند. در میان 21 جهش­یافته اولیه، پنج جهش­یافته کارآیی انتقال ژن موقت را داشتند ولی انتقال ژن دائم به آنها بسیار سخت بود، و یک فنوتیپ ناکارآیی در ادغام T-DNA را بروز می­دادند. Mysore و همکارانش یکی از این جهش­یافته­ها را به نام rat5 مورد بررسی دقیق قرار دادند. این جهش­یافته با وارد کردن یک T-DNA به ناحیه غیر ترجمه شونده 3' یک ژن هیستون H2A به نام HTA1 تولید شده بود. داده­های بیوشیمیایی و مولکولی نشان می­داد که انتقال ژن موقت به خوبی به این جهش­یافته صورت گرفته ولی ادغام T-DNA مختل شده بود. هر چند که نقش دقیق ژن HTA1 در ادغام T-DNA کامل روشن نشده است، انتقال ژن به ریشه این جهش­یافته (و سایر جهش­یافته­های ناکارآ در ادغام T-DAN) می­تواند برای ارسال موقت T-DNA بدون ادغام کارآمد آن استفاده شود. استفاده از ژن HTA1 برای بهبود کارآی انتقال ژن به گیاهان طبیعی در ادامه شرح داده خواهد شد.

Vergunst و همکارانش روش جدیدی برای انتقال پروتئین به طور مستقیم از آگروباکتریوم به سلول گیاهی ارائه کرده­اند. این سیستم بر اساس توانایی سیستم ترشح پروتئین نوع IV است که توسط ژن­های virB و virD4 آگروباکتریوم برای انتقال بعضی پروتئین­های Vir به سلول­های گیاهی رمز می­شود. VirD2، VirE2 و VirF سه پروتئینی هستند که تاکنون توانایی این سیستم در انتقال آنها مشخص شده است. محققان این گروه نشان داده­اند که ترکیب ترجمه­ای یک پروتئین Cre recombinase به پایانه N پروتئین­های VirE2 و VirF، به سلول­های گیاهی منتقل شده و بر نوترکیبی در جایگاه lox تاثیر می­گذارد. آنها همچنین نشان داده­اند که 37 اسید آمینه پایانه C پروتئین VirF برای انتقال کارآمد پروتئین­های ترکیبی کافی می­باشد. این آزمایش­ها به استفاده از پروتئین­های Vir به عنوان حاملی برای وارد کردن موقت سایر پروتئین­ها به داخل سلول گیاهی، منجر خواهد شد.



[1] Nonintegrating

[2] C-terminal

[3] Conserved

 

مطلب قبلی در این زمینه: استفاده از سرکوب گرهای ویروسی خاموشی ژن برای افزایش ابراز ژن تراریخته

Refrence: Stanton B. Gelvin (2003), Agrobacterium-Mediated Plant Transformation: the Biology behind the "Gene-Jockeying" Tool. Microbiology and Molecular Biology Reviews. 67:16-37.


 
comment نظرات ()
 
تجدید دوره آموزشی تکنیک های آزمایشگاه ژنتیک مولکولی
نویسنده : دکتر کسری اصفهانی - ساعت ٦:٢٢ ‎ب.ظ روز ۱۳٩٢/۳/٢٧
 

با توجه به تکمیل ظرفیت دومین دوره آموزشی تکنیک های آزمایشگاه ژنتیک مولکولی (مدرسه تابستانی آموزشی) که 8 تا 11 تیر ماه امسال در مرکز آموزش های تخصصی کوتاه مدت پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری برگزار می شود و تعداد زیاد کسانی که در این دوره آموزشی ثبت نام اولیه نموده اند، گروه برگزار کننده این دوره، کارگاه مشابهی از 15 تا 18 تیر ماه برگزار خواهد کرد.

از همکاران گرامی که تمایل به شرکت در این دوره آموزشی دارند تقاضا می شود از این پس صرفاً برای کارگاه 15 تا 18 تیر ماه ثبت نام کرده و فرم تکمیل شده ثبت نام را به همراه اسکن مدارک لازم از جمله گواهی پرداخت هزینه کارگاه را به نشانی iranbioelearning@gmail.com ارسال نمایید.

در این دوره کوتاه مدت آموزشی که برای دانشجویان علاقمند به انجام پروژه های ژنتیک مولکولی و بیوتکنولوژی برنامه ریزی شده است، تکنیک های معمول آزمایشگاهی مانند PCR، استخراج DNA، هضم آنزیمی، انتقال ژن، الکتروفورز و ... به صورت عملی و نظری آموزش داده می شود و در انتهای دوره آموزشی، به شرکت کنندگانی که با موفقیت دوره را به پایان برسانند، گواهینامه معتبر پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری اعطا می شود.

در این مدرسه تابستانی، این امکان برای شرکت کنندگان وجود دارد که با توجه به علاقه خود در یک یا چند بخش از دوره آموزشی شرکت نمایند. البته در صورت شرکت در کل دوره آموزشی، هزینه ها کاهش می یابد.

برنامه کارگاه

• 15 تیر: آموزش PCR
- آشنایی با اصول PCR، واکنش و برنامه PCR
- انجام PCR
- انواع مختلف و کاربردهای PCR
- مبانی الکتروفورز و جداسازی قطعات DNA
- مشاهده محصولات PCR بر روی ژل آگاروز و آنالیز نتایج

• 16 تیر: طراحی پرایمر
- بررسی و رفع مشکلات احتمالی PCR
- آشنایی با اصول طراحی پرایمر
- آشنایی با نرم افزار Oligo (نرم افزار تخصصی طراحی پرایمر)

• 17 و 18 تیر: مهندسی ژنتیک، کلونینگ DNA و استخراج پلاسمید
- اصول مهندسی ژنتیک و آشنایی با مراحل یک پروژه کلونینگ DNA
- کاربردهای مهندسی ژنتیک
- آنزیم‌های برشی و هضم آنزیمی
- Ligation و کلونینگ DNA هدف
- انتقال DNA نوترکیب به باکتری پذیرنده E. Coli
- روش‌های مختلف آنالیز مولکولی صحت کلونینگ
- تایید کلونینگ با تکنیک Colony PCR
- الکتروفورز و مشاهده نتایج بررسی کلونی‌های نوترکیب
- استخراج پلاسمید به روش Mini-prep با استفاده از کیت




هزینه ها

عادی

• دوره آموزشی چهار روزه کامل تکنیک های آزمایشگاه ژنتیک مولکولی: 350 هزار تومان
- روز اول و دوم کارگاه (آموزش PCR و طراحی پرایمر): 180 هزار تومان
. روز اول کارگاه (آموزش پی سی آر): 100 هزار تومان
. روز دوم کارگاه (طراحی پرایمر): 100 هزار تومان
- روز سوم و چهارم کارگاه (مهندسی ژنتیک، کلونینگ DNA و استخراج پلاسمید): 200 هزار تومان

دانشجویی

• دوره آموزشی چهار روزه کامل تکنیک های آزمایشگاه ژنتیک مولکولی: 300 هزار تومان
- روز اول و دوم کارگاه (آموزش PCR و طراحی پرایمر): 150 هزار تومان
. روز اول کارگاه (آموزش پی سی آر): 80 هزار تومان
. روز دوم کارگاه (طراحی پرایمر): 80 هزار تومان
- روز سوم و چهارم کارگاه (مهندسی ژنتیک، کلونینگ DNA و استخراج پلاسمید): 180 هزار تومان

توجه: هزینه های کارگاه شامل آموزش، مواد کمک آموزشی، مواد مصرفی آزمایشگاهی، ناهار و پذیرایی می باشد.

اقامت: امکان اقامت برای شرکت کنندگان شهرستانی با قیمت ارزان در مهمانسرای پژوهشگاه فراهم است.

این مهمانسرا دارای امکانات رفاهی و شرایط مناسبی بوده و در محوطه پژوهشگاه واقع شده است. هزینه هرشب اقامت در مهمانسرا برای افراد عادی 30 هزار تومان و با توجه به مذاکرات انجام شده برای دانشجویان محترم 20 هزار تومان می باشد.

جهت کسب اطلاعات بیشتر در مورد کارگاه ها و دوره های تخصصی کوتاه مدت پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری می توانید با شماره 44580452 آقای مهدی حسین پور تماس حاصل نمایید.

مکان برگزاری کارگاه: تهران، کیلومتر 17 اتوبان تهران کرج، بلوار پژوهش، پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری.

فرم ثبت نام

صفحه اینترنتی کارگاه


 
comment نظرات ()
 
استفاده از سرکوب گرهای ویروسی خاموشی ژن برای افزایش ابراز ژن تراریخته
نویسنده : دکتر کسری اصفهانی - ساعت ۱۱:٤۳ ‎ق.ظ روز ۱۳٩٢/۱/٢٤
 

داده­های حاصل از تحقیقات چندین آزمایشگاه نشان می­دهد که برخی DNA و RNA ویروس­های گیاهی، دارای ژن­هایی هستند که خاموشی ژن­ها را سرکوب می­کنند.

محققان معتقدند که فعالیت ضد خاموشی ویروسی به عنوان یک سازوکار برای گریز ویروس­ها از دفاع خاموش کردن ژن­های ویروسی توسط گیاه، تکامل یافته است. صرفنظر از علت و سازوکار فعالیت ضد خاموشی، شاید پدیده سرکوب کردن خاموشی توسط ویروس­ها برای کاهش خاموشی تراژن ها مفید باشد. سرکوبگرهای ویروسی خاموشی ژن­ها، می­تواند تراژن­های پایداری که قبلاً خاموش شده­اند را فعال کند. موضوع جالب دیگر توانایی سرکوبگرهای خاموشی در جلوگیری از تراژن­هایی است که به واسطه انتقال ژن توسط آگروباکتریوم وارد گیاه شدند. گرچه این فرضیه هنوز آزمون نشده و عواقب احتمالی منفی آن (مانند افزایش استعداد آسیب­پذیری نسبت به ویروس­ها) که شاید در پی ادغام پایدار ژن­های ضد خاموشی به داخل ژنوم گیاه پیش آید، آزمایش­هایی که در آنها از سرکوبگرهای خاموشی  ویروسی برای افزایش سطح ابراز موقت تراژن­های منتقل­شده با آگروباکتریوم استفاده شده است، امیدبخش به نظر می­رسند.

وقتی تراژن­های مختلف رمزکننده پروتئین فلورسنت سبز (Greenfluorescent protein)، پروتئین Y Nia ویروس سیب­زمینی یا پروتئین­های مقاومت به بیماری Cf-9 و Cf-4 گوجه­فرنگی به طور همزمان با سرکوبگرهای گوناگون خاموشی ویروسی انتقال می­یابند، ابراز این پروتئین­ها افزایش قابل ملاحظه­ای دارند. سطح ابرازی تا 50 برابر گیاهان تراریخته شاهد (بدون ژن­های سرکوبگر خاموشی ویروسی) به دست آمده است.

چندین سرکوبگر خاموشی ویروسی مختلف مانند پروتئین p25 ویروس PVX، پروتئین P1-HcPro ویروس etch توتون (Tobacco Etch Virus) و پروتئین p19 ویروس TBSV (TomatoBushy Stunt Virus)، توانستند ابراز موقت تراژن­ را با آغازگر 35S (Cauliflower Mosaic Virus 35S=CaMV 35S) و آغازگر معمولی تراژن افزایش دهند. در بین اینها، پروتئین p19 بیشتری تاثیرگذاری را در افزایش ابراز موقت تراژن و کاهش سطح مولکول­های کوچک (21 تا 25 جفت بازی) RNA که در خاموشی پس از رونویسی مشارکت دارند، داشته است.

محققان نتیجه گرفتند که سرکوبگرهای ویروسی خاموشی ژن­ها می­توانند برای تولید مقادیر بالای پروتئین­ها در گیاه مفید باشند.

 

مطلب قبلی در این زمینه: استفاده از نواحی متصل‌شونده به ماتریکس برای رفع خاموشی تراژن

 

Refrence: Stanton B. Gelvin (2003), Agrobacterium-Mediated Plant Transformation: the Biology behind the "Gene-Jockeying" Tool. Microbiology and Molecular Biology Reviews. 67:16-37.


 
comment نظرات ()
 
دوره آموزشی تکنیک های آزمایشگاه ژنتیک مولکولی
نویسنده : دکتر کسری اصفهانی - ساعت ۱۱:٥٠ ‎ق.ظ روز ۱۳٩۱/۱٠/۱۸
 

نخستین دوره آموزشی تکنیک های آزمایشگاه ژنتیک مولکولی 6 تا 9 اسفند امسال در مرکز آموزش های تخصصی کوتاه مدت پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری برگزار می شود. همچنین کارگاه آموزشی یک روزه GLP "ویژه آموزش نحوه درست فعالیت و کار با دستگاه های آزمایشگاه ژنتیک مولکولی" مرتبط با این دوره آموزشی، در روز 5 اسفند ماه برگزار می شود.



در دوره آموزشی کوتاه مدت آموزش تکنیک های آزمایشگاه ژنتیک مولکولی که برای دانشجویان علاقمند به انجام پروژه های ژنتیک مولکولی و بیوتکنولوژی برنامه ریزی شده است، تکنیک های معمول آزمایشگاهی مانند PCR، استخراج DNA، هضم آنزیمی، انتقال ژن، الکتروفورز و ... به صورت عملی و نظری آموزش داده می شود و در انتهای دوره آموزشی، گواهینامه معتبر پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری به شرکت کنندگانی که با موفقیت دوره را به پایان برسانند، اعطا می شود.

همچنین در روز قبل از برگزاری این دوره آموزشی چهار روزه، کارگاه آموزشی یک روزه GLP ویژه آموزش نحوه درست کار کردن با دستگاه های آزمایشگاه ژنتیک مولکولی در روز 5 اسفند ماه برگزار می شود. گذراندن این دوره آموزشی برای حضور در آزمایشگاه های معتبری مانند آزمایشگاه های پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری الزامی است و پس از پایان این دوره یک روزه نیز مدرک جداگانه ای به دانش آموختگان اعطا می شود.


ظرفیت پذیرش هر دوره:
20 نفر

مهلت ثبت نام:
28 بهمن 1391


علاقمندان جهت پیش ثبت نام می توانند نام و نام خانوادگی، وضعیت تحصیلی و شماره تماس خود را تا 24 دی ماه به نشانی پست الکترونیکی iranbioelearning@gmail.com ارسال نمایند تا فرم ثبت نام و اطلاعات تکمیلی برای آنها ارسال شود. الویت ثبت نام با افرادی است که پیش ثبت نام نمایند. 

هزینه ها:

افراد عادی

دوره آموزشی چهار روزه تکنیک های آزمایشگاه ژنتیک مولکولی: 350 هزار تومان
کارگاه آموزشی یک روزه GLP: هشتاد هزارتومان
هر دو دوره: 400 هزار تومان

دانشجویی

دوره آموزشی چهار روزه تکنیک های آزمایشگاه ژنتیک مولکولی: 280 هزار تومان 
کارگاه آموزشی یک روزه GLP: هفتاد هزارتومان
هر دو دوره: 320 هزار تومان (20 درصد تخفیف)

دانشجویان پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری 

دوره آموزشی چهار روزه تکنیک های آزمایشگاه ژنتیک مولکولی: 270 هزار تومان
کارگاه آموزشی یک روزه GLP: پنجاه هزارتومان
هر دو دوره: 300 هزار تومان (25 درصد تخفیف)

هزینه ها شامل آموزش، مواد کمک آموزشی، مواد مصرفی آزمایشگاهی و پذیرایی می باشد.

اقامت: امکان اقامت برای شرکت کنندگان شهرستانی با قیمت ارزان در مهمانسرای پژوهشگاه فراهم است. این مهمانسرا دارای امکانات رفاهی و شرایط مناسبی بوده و در محوطه پژوهشگاه واقع شده است. هزینه هرشب اقامت در مهمانسرا برای افراد عادی 25 هزار تومان و با توجه به مذاکرات انجام شده برای دانشجویان محترم 15 هزار تومان می باشد. 

جهت کسب اطلاعات بیشتر در مورد کارگاه ها و دوره های تخصصی کوتاه مدت پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری می توانید با شماره های 09102979232 یا 44580322 تماس حاصل نمایید.

مکان برگزاری کارگاه: تهران، کیلومتر 17 اتوبان تهران کرج، بلوار پژوهش، پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری



 
comment نظرات ()
 
دومین کارگاه آشنایی با تکنیک‌های مهندسی ژنتیک
نویسنده : دکتر کسری اصفهانی - ساعت ٥:۳٧ ‎ب.ظ روز ۱۳٩۱/٧/٢۱
 

کارگاه آشنایی با تکنیک‌های مهندسی ژنتیک از سری کارگاه‌های برنامه ریزی شده توسط شرکت دانا ژن ‌پژوه و شبکه پزشکی مولکولی در دو قسمت نظری و عملی، در روزهای 27 و 28 مهر ماه سال 1391 برگزار خواهد ‌شد. مهلت ثبت نام در این کارگاه تا ساعت 10 صبح 26 مهر 1391 می باشد و دانشجویان و اعضای شبکه از 20 درصد تخفیف هزینه شرکت در کارگاه برخوردار هستند.

مهندسی‌ژنتیک و تکنیک‌های مورد استفاده در آن، علم زیست‌شناسی را دگرگون کرده است. با ظهور مهندسی‌ژنتیک و فناوری DNA نوترکیب، انسان به فناوری دست‌ورزی ژنتیکی موجودات زنده دست یافت و هم‌اکنون می‌تواند برای رفع نیازهای خود، به طور موثرتری موجودات زنده را به کار گیرد. مهندسی ژنتیک در کشاورزی، پزشکی و صنایع دارویی، صنایع تخمیری، صنایع نظامی، انرژی و محیط‌زیست کاربردهای گسترده‌ای داشته و از این جهت مطالب این کارگاه برای فارغ‌التحصیلان و دانشجویان رشته‌های بیوتکنولوژی، ژنتیک‌‌مولکولی، گرایش‌های مختلف زیست‌شناسی، محیط‌ زیست، پزشکی، گیاهپزشکی، زراعت، باغبانی، صنایع‌غذایی و تمامی افرادی که به مباحث بیوتکنولوژی و مهندسی ژنتیک علاقمند می‌باشند، مناسب است.

سرفصل‌های کارگاه

• اصول مهندسی ژنتیک و آشنایی با مراحل یک پروژه کلونینگ DNA
• کاربردهای مهندسی ژنتیک
• آنزیم‌های برشی و هضم آنزیمی
• Ligation و کلونینگ DNA هدف
• انتقال DNA نوترکیب به باکتری پذیرنده E. coli
• بررسی روش‌های مختلف آنالیز مولکولی صحت کلونینگ
• تایید کلونینگ با تکنیک Colony PCR
• استفاده از الکتروفورز و مشاهده نتایج بررسی کلونی‌های نوترکیب

زمان برگزاری: روزهای 16 و 17 آذر 1391 از ساعت 8 تا 14

مهلت ثبت نام: ساعت 10 صبح 15 آذر 1391


دانشجویان و اعضای شبکه پزشکی مولکولی کشور از 20 درصد تخفیف هزینه شرکت در کارگاه برخوردار هستند.

در پایان به شرکت‌کنندگان گواهی معتبر با تایید شبکه پزشکی مولکولی ایران اعطا می‌گردد.


محل برگزاری کارگاه: تهران، خیابان پاسداران، خیابان شهید محمود گل‌نبی، پلاک 24، طبقه دوم، شرکت دانا ژن پژوه

با توجه به اینکه برای آموزش موثر، حداکثر تعداد شرکت کننده این کارگاه 12 نفر می‌باشد، الویت شرکت در کارگاه با کسانی است که زودتر ثبت نام نمایند و افرادی که با تاخیر ثبت نام نمایند، در الویت برگزاری کارگاه های بعدی قرار خواهند گرفت.

علاقمندان می‌توانند جهت اطلاعات بیشتر با شماره تلفن‌های 22887180-021 یا 09124708799 تماس حاصل فرمایند.

خبر کارگاه در سایت شبکه پزشکی مولکولی ایران

خبر کارگاه در خبرگزاری ایسنا

کارگاه های شرکت دانا ژن پژوه با همکاری شبکه پزشکی مولکولی ایران

صفحه اینترنتی کارگاه

ثبت نام در کارگاه
 


 
ادامه مطلب...
comment نظرات ()